つくばエクスプレスを運営する首都圏新都市鉄道は、2019年2月28日(木)に茨城県つくばみらい市に所在し、同社のすべての所属車両の管理や検査などを行う総合基地内で、脱線事故が発生したと発表しました。発生時刻は同日の16時10分頃です。
当時は、列車機能の試験中で、車両が所定の停止位置に停止することができず、車止めに衝突、先頭に連結していた1号車が脱線したとのことです。
この影響で、16時10分から16時16分までの間、つくばエクスプレスの全線の運転を見合わせました。原因については、調査中としています。